6月5日，廣州市南沙區發布通告稱，為配合全員核酸檢測工作，自2021年6月5日14時起，自2021年6月5日14時起，全區城市公交、地鐵、輪渡、長途客運暫停運營；無特殊原因，市民不要離開，高快速路、高鐵、碼頭等全部離南沙通道暫時關閉，恢復時間另行通告。

　　6月6日，廣州市南沙區再次發布通告，稱南沙區內車輛原則上只進不出，并提出如下指導意見：

　　一、在南沙港區作業的貨車，由廣州港集團按照疫情防控工作要求，加強對進入港區車輛司機防疫管理。離開南沙區時，按照“點對點”閉環管理原則，司乘人員須持有72小時內核酸檢測陰性證明，且只能通過南沙港快速及與其連接的高速公路進出港區。

　　二、南沙區（除南沙港區外）的貨車，離開南沙區時，司乘人員須除持有72小時內核酸檢測陰性證明外，還須出示單位有關證明。

　　三、除上述車輛外，有防疫任務或特殊情況的單位需離開南沙區的，須提出具體要求，由對口行業主管部門審定后實施分級分類管理，在做好防疫檢查后予以放行。

　　四、小客車除執行第三條外，司乘人員須持有72小時內核酸檢測陰性證明。

　　隨后，廣州港也發布通告稱，為進一步管控港區疫情輸入風險，保障各位司機的身體健康，進出南沙港區作業的貨車司機，需要執行以下防疫措施：

　　1、碼頭所有涉及拖車的預約進港和單證業務，全部通過相應公司網站、微信等線上辦理，無須與碼頭人員接觸。

　　2、司機進入碼頭前，需掃閘口處場所碼，經碼頭工作人員檢查，體溫正常、粵康碼顯示綠碼才可進閘。

　　3、司機進入碼頭后，需全程戴口罩，嚴禁司機下車，嚴禁丟棄物品垃圾等；如裝卸過程中遇到特殊情況，電話聯系碼頭中控（見進港證的背面）。

　　4、貨車離開碼頭后，按照南沙區政府防疫“點對點”閉環管理原則，只能通過南沙港快速路及與其連接的高速公路。

　　5、目前南沙港區(南沙一二三期集裝箱碼頭，南沙糧食通用碼頭，南沙汽車碼頭，南沙港發石化碼頭，南沙小虎石化碼頭)，大船班期，駁船，拖車作業一切正常。

　　如有違反以上規定，碼頭按違章處理，并報送政府防疫部門處理。

　　如有任何疑問，請致電碼頭服務熱線咨詢，南沙一二期碼頭：020-34661912，南沙三期碼頭：020-84528696，南沙糧食通用碼頭：020-39086816，南沙汽車碼頭：020-34689000，南沙港發石化碼頭：1371121 3037，南沙小虎石化碼頭：020-34688602。

　　此前，受疫情影響，鹽田港的港口作業速度大幅下降，大量貨物排隊涌入鹽田港周邊的蛇口港、廣州南沙港，如今南沙港實施疫情管控后，預計港口作業也將受到一定程度影響，將會有更多貨物涌入周邊港口，蛇口港近日發布通知稱，CCT/MCT、SCT將于2021年6月6日零點起調整收出口重箱時間，僅接收船舶預計到港日期（簡稱：ETA）3天內的出口重箱。當航運熱遇上疫情，大家都太難了。